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Genome-Scale Algorithm Design

Bioinformatics in the Era of High-Throughput Sequencing

Djamal Belazzougui, Fabio Cunial, Veli Mäkinen, Alexandru I. Tomescu


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Presenting the fundamental algorithms and data structures that power bioinformatics workflows, this book covers a range of topics from the foundations of sequence analysis (alignments and hidden Markov models) to classical index structures (k-mer indexes, suffix arrays, and suffix trees), Burrows–Wheeler indexes, graph algorithms, network flows, and a number of advanced omics applications. The chapters feature numerous examples, algorithm visualizations, and exercises, providing graduate students, researchers, and practitioners with a powerful algorithmic toolkit for the applications of high-throughput sequencing. An accompanying website (www.genome-scale.info) offers supporting teaching material. The second edition strengthens the toolkit by covering minimizers and other advanced data structures and their use in emerging pangenomics approaches.

Détails
Auteur
Djamal  Belazzougui , Fabio  Cunial , Veli  Mäkinen , Alexandru I.  Tomescu
Marque
Cambridge University Press
Collection
n.c
Parution
2023-10-12
Pages
n.c
EAN papier
9781009341233
Langue
Anglais
Informations ebook
EAN PDF
9781009341219
Prix
68,67 €
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Nb pages copiables 0
Nb pages imprimables 0
Taille du fichier 8673 Ko
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